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wb实验常见诊断报告和优化方案
2019年08月08日 13:56   生物.医药.天然产物
关键词:wb实验

实验案例1:泳道高背景

问题分析:多条带以及高背景集中在泳道上,大概率是样本时间太久,或者蛋白酶抑制剂没加发生了蛋白降解,或者是组织样本中,成分太复杂,加上抗体特异性一般造成的。

问题诊断

  1. 1. 样本时间太久
  2. 2. 组织样本背景高
  3. 3. 蛋白酶抑制剂/磷酸酶抑制剂没有加

建议方案

新鲜制备样本,加入蛋白酶抑制剂。对于组织样本,要求超声。对于特异性一般的抗体,先用细胞样本做下。

  

实验案例2:全膜高背景

问题分析:像这种全膜的高背景,大概率是缓冲液的问题。可以提高封闭液浓度和封闭时间,抗体稀释液使用5%脱脂牛奶或者根据说明书要求来,洗涤的TBST增加nacl浓度以及吐温浓度,增加洗涤的次数和时间。

问题诊断

  1. 1. 封闭液
  2. 2. 抗体稀释液
  3. 3. 洗涤

建议方案

封闭液使用5%脱脂牛奶(新鲜配置),4度封闭过夜。抗体稀释液使用5%脱脂牛奶,TBST中nacl浓度增加至500mM,吐温增加至0.5%,洗涤15min*3次或者10min*4次。

PS:这个case客户本来使用1%BSA稀释抗体,换用5%BSA,背景就没问题了

  

实验案例3:全膜高背景

问题分析:排除二抗非特异性,就是不加一抗,直接加二抗孵育,看是否有非特异性条带,对于一般客户来说,更换二抗是更加简便的方法。(能拿结果,不仅仅验证),二抗稀释液强烈推荐5%脱脂牛奶,如果前两者都无法改善结果,考虑一抗非特异性。

问题诊断

  1. 1. 二抗非特异性
  2. 2. 抗体稀释液
  3. 3. 一抗非特异性

建议方案

更换二抗,排除二抗非特异西,二抗稀释液使用5%脱脂牛奶,更换一抗。

更换二抗后【如左图】

  

实验案例4:高背景、杂带

问题分析:全膜的背景问题,主要是一抗二抗未洗涤干净,基本残留在膜上。

问题诊断

  1. 1. 洗涤不充分

建议方案

TBST中nacl浓度增加至500mM,吐温增加至0.5%,洗涤15min*3次或者10min*4次

优化后结果【如左图】

  

实验案例5:条带过粗、杂带

问题分析:条带过于粗往往是因为样本上样量太高,一抗浓度高,加上曝光时间久。

问题诊断

  1. 1. 样本信号太强
  2. 2. 杂带多
  3. 3. 曝光时间太久

建议方案

减少上样量,减少一抗浓度,减少曝光时间。

优化后结果【如左图】

  

实验案例6:不出带

问题分析:一般没条带的主要关注样本表达量,文献或者看上下游蛋白结果,如果是磷酸化的,还要看上下游的磷酸化。对于大分子量(150KD以上)或者小分子蛋白(小于20KD),看下丽春红染色,确认转膜效率。抗体浓度和曝光时间帮助增强信号。

问题诊断

  1. 1. 样本表达量和处理方式
  2. 2. 转膜
  3. 3. 抗体浓度
  4. 4. 曝光时间

建议方案

增加上样量,使用合适的刺激处理方式,增加阳性对照,增加一抗浓度,增加曝光时间。


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